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关于“小分子药物靶点筛选”

小分子药物靶点筛选

在药物研发的过程中,用药物来筛选作用靶点是一个非常重要的环节,能否发现并验证到正确的药物靶点直接关系到后续药物研发的成败。青云瑞晶推出基于化学蛋白质组学的两种最新药物靶点筛选方案——有限蛋白水解质谱技术(LiP-MS)与热蛋白质组学分析(TPP),可以从全蛋白质组层面,高效精准筛选出药物分子可能作用的蛋白靶点。我们提供基于该技术的全套解决方案,包含从样本处理、数据检测到生信分析全流程,加速药物研发进程。

  • 有限蛋白水解质谱技术(LiP-MS)
  • 热蛋白质组学分析(TPP)

LiP-MS

有限蛋白水解质谱技术(Limited Proteolysis Mass Spectrometry)是一种通过研究小分子化合物(天然产物、代谢物等)与蛋白质相互作用,进行药物靶点筛选的技术。

通过小分子药物以单一浓度或多个浓度与细胞裂解物共同孵育,随后短暂暴露于非特异性蛋白酶进行有限酶切。由于小分子药物与蛋白质的结合可能引起蛋白质构象的变化,这种构象变化会影响蛋白酶的切割位点可及性,从而在有限的蛋白酶解过程中产生靶蛋白的特异性片段。接下来,使用胰蛋白酶对这些蛋白质片段进行进一步消化,生成适合定量质谱分析的肽段。通过比较药物处理样品与未处理样品中肽段的丰度差异,可精确识别出与小分子药物结合的蛋白质及其作用位点。

应用范围

  • 小分子药物潜在靶点筛选
  • 药物机制研究
  • 药物-蛋白结合域分析
  • 老药新用

技术优势

  • 无需探针设计与化学修饰

    可直接使用药物分子进行实验,避免对小分子改构。

  • 样本兼容广

    支持复杂生物样本(如菌体、组织液、细胞裂解液等)。

  • 原位分析

    在接近天然的生理环境中直接获取蛋白和小分子的相互作用。

  • 双维度信息获取

    可同时检测蛋白的丰度和结构变化。

  • 结果简单直接

    结合生信分析,快速获取可能结合靶点名称序列。

  • 机制分析

    结果可直接定位到小分子与蛋白结合的位点,揭示药物作用模式(如变构/正构等)。

筛选流程

  • 样品准备

  • 药物处理

    细胞裂解物 添加小分子

    细胞裂解物 不添加小分子

  • 蛋白酶解与收集

    添加小分子:LiP+Trp&Trp

    不添加小分子:LiP+Trp&Trp

  • 质谱检测

    使用Orbitrap Eclipse/Orbitrap Exploris480质谱仪检测

  • 数据处理

    丰度变化信息

    结构变化信息

  • 生信分析

    功能富集分析

    相互作用分析

服务配置

报告结果 蛋白肽段鉴定信息表 PPI PCA/PLS-
DA分析
肽段Barcode图 相关性热图 Wood's图 差异分析
火山图
Peptide
profile图
肽段定量
热图
蛋白质结
构图
GO/KEGG
LiP-MS
药物靶点筛选
附加收费项目 分子对接、竞争性测试、分子互作测试(SPR/MST/ITC)、敲低实验、细胞验证实验、动物验证实验

TPP

热蛋白质组学分析 (Thermal Proteome Profiling)是一种通过检测蛋白质热稳定性,确认与小分子结合的靶蛋白的药物靶点筛选技术。

药物与靶蛋白结合后,由于蛋白的构象、疏水性会产生变化或形成化学交联,引起靶蛋白热稳定性变化。在实验中,通过在梯度温度下处理蛋白质样品,检测蛋白质的热变性曲线,可以发现药物处理后靶蛋白的热稳定性变化,并利用质谱技术对全蛋白质组进行定量分析,从而实现药物靶点的筛选。

应用范围

  • 药物靶点筛选
  • 疾病标志物发现
  • 蛋白功能研究

技术优势

  • 蛋白组学规模覆盖

    全蛋白组水平筛选药物靶点,一次实验可覆盖3000–8000种蛋白质,覆盖率高。

  • 无需探针设计与化学修饰

    可直接使用药物分子进行实验,得到最真实的药靶结合信息。

  • 样本兼容广

    支持复杂生物样本(如活细胞、组织、菌体等多种样本类型)。

  • 预测直接/间接靶点

    预测可能存在的直接靶点与间接作用蛋白,有效提升药物靶点筛选效率。

  • 可原位/原态操作(in-cell/in-lysate)

    可在完整细胞、裂解液,甚至组织样本中进行,保留天然蛋白质复合物和胞内环境。

筛选流程

  • 样品准备

  • 药物处理

    活细胞 添加小分子

    活细胞 不添加小分子

  • 温度梯度处理

    【单温度】
    1个温度,52 ℃

    【多温度】
    10个温度,37~74℃

  • 质谱检测

    使用
    Orbitrap Eclipse/
    Orbitrap Exploris 480
    质谱仪检测

  • 数据处理

    相关性分析

    聚类分析

  • 生信分析

    【差异蛋白筛选】
    聚类热图、热熔曲线拟合
    【功能富集分析】
    GO富集分析…
    【相互作用分析】
    相互作用网络绘制

服务配置

报告结果 蛋白肽段鉴定
信息表
PCA/PLS-DA分析 相关性热图 差异分析火山图 差异分析火山图 GO/KEGG PPI分析
TPP 药物靶点筛选
附加收费项目 分子对接、竞争性测试、分子互作测试(SPR/MST/ITC)、敲低实验、细胞验证实验、动物验证实验
LNP表征

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