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关于“定量蛋白质组学”

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定量蛋白质组学

蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程都有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中，常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学是把一个基因组所表达的全部蛋白或者是一个复杂体系所有的全部蛋白进行鉴定和定量的方法。

Bruker timsTOF Pro 2
Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480
Thermo Scientific Q Exactive HF-X

服务内容

4D DIA / DIA蛋白质组学
4D Lable-free / Lable-free蛋白质组学
TMT/iTRAQ 蛋白质组学
SILAC蛋白质组学

4D DIA / DIA蛋白质组学
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4D-DIA

4D-DIA基于timsTOF Pro2质谱仪，在传统三维数据（保留时间、质荷比、离子强度）的基础上增加了第四个维度，离子淌度信息。4D-DIA利用diaPASEF技术能够全面提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性。

DIA

数据非依赖性采集（Data Independent Acquisition，DIA）适用于数量大、复杂程度高、个体差异大的样本。DIA提供条件统一、无差别的质谱采集方法，样品在进入二级质谱时，按照设定的质和比m/z范围，对该范围内所有的母离子进行碎片化，而不是依赖信号强度进行母离子的挑选。

技术优势

覆盖度高

稳定性高、重复性好

检测深度高

适用于大规模样本的蛋白组分析

技术原理
4D Lable-free / Lable-free蛋白质组学
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4D Lable-free

4D-Label free是基于timsTOF Pro2质谱平台检测的非标记定量蛋白组学技术，在传统三维数据（保留时间、质荷比、离子强度）的基础上增加了第四个维度，离子淌度的信息。与传统Label free相比，4D-Lable free的离子利用率和准确度更高，能以更少的上样量，实现高灵敏度、高通量、高精确度的蛋白检测。

Lable free

LFQ（lable-free quantification），是一种非标记定量技术。无需使用稳定同位素标签对肽段进行标记，直接使用液相质谱联用仪对蛋白质酶解肽段样本进行数据采集，通过比较不同样品中相应肽段的信号强度或谱图数，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

技术优势

适用范围广

操作简单

成本低

检测通量高

深度高

定性准确性好

技术原理
TMT/iTRAQ 蛋白质组学
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TMT

TMT（Tandem Mass Tags）技术是由Thermo Fisher公司研发的多肽体外标记定量技术。这个技术采用多种（2-18）稳定同位素标签，特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析，同时比较多个样本中蛋白质的相对含量。

iTRAQ

iTRAQ是由AB公司研发的一种多肽体外标记定量技术，该技术采用4种或8种同位素标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，进行串联质谱分析。

技术优势

方法成熟

通量高

误差小、重复性好

定性准确性好

适合同时比较2-16个样品

技术原理
SILAC蛋白质组学
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细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记技术 (Stable isotope labeling by amino acids in cell culture, SILAC) 是基于质谱 (MS) 的定量蛋白质组学中一种简单、稳定而强大的方法。基于 SILAC 的定量蛋白质组学可以用于鉴定外源性蛋白质-蛋白质相互作用 (Protein–protein interactions, PPIs)、内源性 PPls 、或诱导型 PPls 中的特异性相互作用蛋白。

技术优势

高效性

定量精准

高通量

高灵敏度

活体标记

相容性

技术原理

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